يهدف المركز إلى المساهمة في تنمية المجتمع الفلسطيني ورفع مستواه الاقتصادي والاجتماعي والعلمي وخلق المناخ العلمي والتقني ومسايرة التقدم العلمي في العالم والمشاركة فيه ومواكبة الحضارة العلمية العالمية والمشاركة فيها. ويكون الهدف الرئيسي للمركز استيعاب ونقل وتوطين .علوم وتقنيات الاشعاع وتطوير الاستخدام السلمي لطاقة الاشعاع على المستوى الوطني على كل المحاور.

أما مهام المركز على طريق تحقيق الاهداف فهي:

  • المساهمة في المحافظة على الصحة العامة عن طريق مراقبة التلوث الاشعاعي للبيئة الفلسطينية وحماية الانسان الفلسطيني من اخطار التلوث الاشعاعي وتطبيق أسس الوقاية الاشعاعية في مجال .الاستخدام السلمي لطاقة الاشعاع.
  • المساعدة على توفير إمكانية البحث العلمي والتقاني والنهوض به في حقل الاستخدامات السلمية .للطاقة الذرية في المؤسسات العلمية الفلسطنية .
  • تأهيل و إعداد القوى البشرية الفلسطينية في حقل العلوم الاشعاعية وتقانتها.
  • نشر الوعي العلمي في مجال علوم الاشعاع وتطبيقاتها السلمية وعلى مستوى قطاعات واسعة .وخلق حالة الوعي تلك لدى عموم الشعب.
  • المشاركة في المؤتمرات والدورات التي تهتم بعلوم الإشعاع وتطبيقها.
  • تقديم الاستشارات العلمية للمؤسسات الفلسطينية ودراسات الجدوى وإنشاء المشاريع التقنية بالتعاون مع المؤسسات الدولية والعربية ذات العلاقة.
  • التعاون مع الجامعات الفلسطينية الأخرى ومؤسسات السلطة الوطنية والتنسيق معها في مجال إدخال المنهاج التعليمية الخاصة بالعلوم الإشعاعية وتطبيقاتها.